生物工程学院前身为轻工业工程系，始建于1981年，是浙江省第一个和全国较早设立生物工程学科和专业的学院。学院历经轻工业工程系、生物与环境工程学院，2015年9月成立生物工程学院。现有生物工程和生物技术2个本科专业，生物工程一级学科硕士点，生物化工、微生物学、生物化学与分子生物学3个二级学科硕士点，生物与医药领域专业学位硕士点，生物化工博士点，已成为国内高水平生物工程专业技术人才凝聚地和培养中心，在国内外生物工程学术界和产业界享有较高的知名度和影响力。

学院下设酶与生物催化工程研究所、微生物与发酵工程研究所、生物制药与生物材料研究所、合成生物技术研究所和生物资源与生物环保研究所5个研究所，现有教职工120人，其中中国工程院院士2人，省部级以上人才26人，具有高级专业技术职务的教师59人，具有博士学位和海外留学、工作经历的专任教师分别达到90%和50%以上。聘用海外知名高校的客座教授20余人。目前在校本科生620余人，硕、博研究生820余人。办学40余年来，学院已培养毕业生4000多人，一大批毕业生在海内外高等学校、科研院所、政府机关、企事业单位担任了重要的管理和技术职务，为经济社会发展做出了突出的贡献。

学院建有手性生物制造国家地方联合工程研究中心、生物转化与生物净化教育部工程研究中心、国家“2011计划”长三角绿色制药协同创新中心生物制药中心、国家化学原料药合成工程技术研究中心生物制药中心、绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地生物合成技术实验室、可再生资源利用与加工国家级实验教学示范中心、浙江省生物有机合成技术研究重点实验室、中国石油和化工行业药用化学品生物催化重点实验室、浙江省手性生物制造工程实验室、生物基础浙江省实验教学示范中心、浙江省现代生物产业学院等一批国家级、省部级教学与科研平台。学院拥有全国高校黄大年式教师团队、“生物催化与微生物发酵”浙江省首批重点科技创新团队，同时是“生物净化和生物转化”教育部创新团队、“三药”浙江省创新团队的主要成员。

生物工程一级学科列入浙江省重中之重学科、浙江省“一流学科建设计划”（A类）、浙江省“重点高校建设计划”第一批重点建设学科和“十四五”省一流学科（A类）。生物工程专业是国家一流专业、国家特色专业和浙江省优势专业，通过了中国工程教育专业认证协会组织的工程教育认证。生物技术专业是国家一流专业、浙江省一流专业和浙江省新兴特色专业。

《生物化学》、《生物工程设备》、《微生物学》和《荧光蛋白的中试发酵生产虚拟仿真实验》是国家级一流本科课程，《微生物学》和《生物工程设备》是国家精品课程和国家精品资源共享课，《生物钟与健康》是国家精品视频公开课；《生物化学》、《微生物学》、《生物工程设备》、《酶工程》、《细胞工程》、《生工产业实践教育》、《荧光蛋白的中试发酵生产虚拟仿真实验》和《阿卡波糖工业化发酵生产及其车间设计的3D虚拟仿真实训》是浙江省一流课程,《微生物学》、《生物化学》是浙江省精品在线开放课程和浙江省本科院校“互联网+教学”示范课堂，《微生物学》、《生物化学》、《基因工程技术》、《生物工程设备》是浙江省精品课程，《基因工程》和《药物生物信息学》是浙江省优秀研究生课程。学院获国家级教学成果奖二等奖1项、浙江省教学成果奖特等奖1项、浙江省教学成果奖二等奖1项等，出版国家级规划教材和省重点教材10余部。学生获中国“互联网+”大学生创新创业大赛金奖、“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛金奖、国际基因工程机器大赛（iGEM）金奖、全国大学生生命科学创新创业大赛特等奖等奖项。

近年来，学院承担了国家重点研发计划项目、国家重点基础研究发展计划（973计划）项目、国家高技术发展计划（863计划）项目、国家重大科技专项、国家科技支撑计划项目、国家自然科学基金项目、浙江省自然科学基金重点项目、浙江省杰出青年基金项目和浙江省科技重大专项等国家级、省部级项目，同时也承担了企业委托与合作开发的重大产业化项目。发明专利申请数和授权数分列中国科学院《中国工业生物技术白皮书2019》第15和第11位，建成工业化生产装置和生产线40余条。获国家技术发明二等奖2项、国家科技进步二等奖1项、中国专利优秀奖3项、省部级科学技术奖一等奖12项、省部级科学技术奖二等奖3项、浙江省专利金奖2项。

学院广泛开展对外交流与合作，已与美国、德国、日本、加拿大、澳大利亚、比利时等诸多海外院校建立了全面合作关系。

学院秉持“探索未知，激情求解”的院训精神，各项工作取得了令人瞩目的成绩，获得了全国教育系统先进集体、全国高校党建工作样板支部、浙江省高校先进基层党组织等称号，被列为“全国党建工作标杆院系”培育创建单位。学院教师荣获何梁何利基金科学与技术进步奖、中国首届农药学科终身成就奖、杜邦科技创新奖、候德榜化工科学技术奖、浙江省科学技术重大贡献奖、全国优秀科技工作者、全国师德标兵、浙江省功勋教师、浙江省优秀教师等省部级以上奖励和荣誉30余人次。 

更新于2023年12月